歷史的轉折點是1388年,這一年,明朝大將藍玉帶著十五萬精兵,跑了很遠的路,在捕魚兒海,就是今天的貝爾湖那一帶,直接端了北元皇帝脫古思帖木兒的老巢,這一仗,北元的主力基本上全沒了,皇子、后妃、官員加上老百姓七萬多人都被抓了,牛馬輜重全成了明軍的戰利品,脫古思帖木兒自己就帶了幾十個人跑了,大元的朝廷班底,在這一仗里算是徹底被打散了。
捕魚兒海這一仗的後果,不只是軍事上輸得慘,脫古思帖木兒跑到土拉河的時候,他手下的一個將領也速迭兒反了,把他給勒死了,自己當了大汗,這個也速迭兒不是成吉思汗的黃金家族後代,為了顯示這是個新時代,他乾了一件大事,廢除了「大元」的國號,又用回了「大蒙古國」這個名字,從忽必烈那兒傳下來的「大元」法統,在漠北延續了20年後,就在這刀光劍影里,正式沒了。
「大元」國號一沒,蒙古高原就進入了一個更亂的時代,黃金家族的威信掉到了谷底,蒙古各個部落又開始長期的分裂和內鬥,我們後來熟悉的「韃靼」和「瓦剌」這兩大部落集團的對立,就是在這個時候形成的,韃靼部名義上還是黃金家族的後代當大汗,可大多時候就是個擺設,西邊的瓦剌部,實權都在非黃金家族的強人手裡,他們不停地挑戰成吉思汗子孫的地位。
這裡面最有名的一件事,就是1449年的「土木堡之變」,當時,西邊瓦剌部的頭頭也先,帶著東邊韃靼部的傀儡大汗脫脫不花,大舉南下,那時候的韃靼部,雖然名義上大汗還是黃金家族的人,可早就沒了「北元」的那個政權架子,在強大的瓦剌面前,更像個跟班,也先用他超強的軍事能力,在土木堡一下子打垮了明朝二十萬精兵,還把親自帶兵的明英宗朱祁鎮給抓了,這事兒震動了整個中原,也說明了,蒙古高原這時候的主導權,已經從黃金家族手裡,轉到了強大的部落聯盟領袖手裡。
在這段漫長的部落混戰史里,有個東西被後來說了又說,那就是「傳國玉璽」,傳說元朝的玉璽在元順帝北撤的時候一起帶到了草原,到了17世紀,最後一個想重現成吉思汗偉業的蒙古大汗,林丹汗,在跟崛起的後金,也就是滿清的前身打仗時輸了,1634年在青海病死了,他的兒子額哲,沒辦法,第二年就帶著部眾向後金的皇太極投降了。
在投降儀式上,額哲獻上了一枚號稱是「元朝傳國玉璽」的寶貝,皇太極拿到手跟得了寶一樣,馬上就用這個來證明自己是「天命所歸」,宣稱自己繼承了大元的法統,還把國號從「金」改成了「大清」,可現在的歷史研究都覺得,元朝真正的傳國玉璽很可能早就在元末打仗的時候丟了,皇太極拿到的這個,很可能是後來蒙古部落自己仿造的,它在當時的作用,更多的是一種政治宣傳工具,不是什麼真實的歷史信物。