意外發生在2014年6月,當時張祥慧剛離開小英教育基金會,卻遭到一輛快速行駛的機車猛力撞擊,頭部嚴重受創。
她隨即被緊急送往中興醫院急救,當時蔡英文辦公室發出聲明指出,張祥慧手術後已轉入加護病房接受觀察治療,家人與友人都已趕赴醫院陪伴,並對外界的關懷表達感謝。